اداره امور خوابگاه ها مسئولیت کنترل و نظارت و اسکان 3700 نفر از دانشجویان این دانشگاه در 9 خوابگاه مجردی دختران ، 3 خوابگاه مجردی پسران و 3 خوابگاه متاهلین جمعا به تعداد 15 خوابگاه را به عهده دارد. این اداره علاوه بر اسکان دانشجویان غیر بومی پذیرفته شده دانشگاه علوم پزشکی شیراز ، دانشجویان اقماری دانشکده های آباده ، ممسنی ، لامرد ، استهبان ، داراب و سپیدان را نیز طی دوره های خاص زیر پوشش دارد . هدف کلی این اداره ساماندهی و ارتقاء ارائه خدمات خوابگاهی و رفاهی به دانشجویان ساکن در خوابگاه ها می باشد.

شرح وظایف و خدمات واحد:

1. اسکان دانشجویان  (واگذاری خوابگاه به دانشجویان اعم از متاهلی ، برادران و خواهران) 
2. کنترل وضعیت رفت و آمد دانشجویان به خوابگاه ها
3. حفظ و نگهداری اموال در خوابگاه ها
4. نظارت بر تسویه حساب دانشجویان ساکن خوابگاه ها
5. نظارت کلی بر خوابگاه ها از نظر عمرانی ، رفاهی ، اخلاقی و تاسیساتی
6. پیگیری مشکلات دانشجویان و طرح مشکل در کمیته اسکان
7. همکاری در انجام فعالیت های فرهنگی ، مذهبی ، جشن و اعیاد در خوابگاه ها